LabDAO kaardistab avatud lähtekoodiga AI tulevikku ravimite avastamiseks

Projekt Folding@home jõudis COVID-19 pandeemia ajal uudistesse, et suunata kasutamata arvutusvõimsust, et uurida valgu voltimise otsinguruumi, et võidelda uudse koroonaviirusega. Võimaldades kodanikel olla omaette teadlasteks, viis algatus läbi laiaulatuslike valkude erinevate molekulaarsete konfiguratsioonide simulatsioonid üle kogu maailma "registreeritud" arvutite hajutatud võrgus.

See detsentraliseeritud paradigma kuulutati inimeste koondamiseks ühise probleemi ümber ja tõhusaks arvutusvõimsuse hankimiseks, kuid mis siis, kui arvutusvõimsus ja probleemide lahendamise infrastruktuur oleksid ümber pööratud? Teisisõnu, mis siis, kui üksikisikud saaksid juhtida oma projekte, kasutades ära kogunenud arvutusvõimsust ja vahendid bioloogiliseks katsetamiseks käivitamiseks?

LabDAO muudab selle unistuse oma PLEX-platvormiga reaalsuseks. PLEX on avatud lähtekoodiga käsurea tööriist, mis on loodud mitte ainult arvutusressursside, vaid ka mitmesuguste bioloogiliste masinõppe tööriistade (loodud LabDAO-s "BioML" komplekti) kättesaadavaks muutmiseks erinevatel taustadel. Olenemata sellest, kas katsetada väikese molekuliga dokkimist või valgu voltimise simulatsioone, võimaldab PLEX kasutajatel kasutada LabDAO tööriistade teeki, jagada tulemusi ja visualiseerida neid vähem kui viie minutiga.

See tööriistakomplekt ja selle peal olev kasutust võimaldav platvorm esitati aprilli alguses Zuzalu Blockchain Meets Biology tippkohtumisel, kus LabDAO põhimeeskonna liige Lily Hansen-Gillis demonstreeris algusest lõpuni ühe molekuli sisemise molekulaarse dünaamika simulatsiooni. valku, et leida selle kõige stabiilsem konfiguratsioon. Seejärel juhatas ta ennast "mittekodeerijana" nimetava publikuga algusest lõpuni läbi – kõik arvuti, WiFi, PLEX käsureal ja ei midagi enamat.

Laiemas plaanis on LabDAO web3-toega detsentraliseeritud platvorm (osa suuremast "DeSci" liikumisest), mis on pühendunud produktiivsema keskkonna loomisele avatud lähtekoodiga ravimite avastamiseks. Tehes tipptasemel tööriistad ja ressursid kättesaadavaks laiemale ökosüsteemile, püüab LabDAO luua õige keskkonna läbipaistvate ja juurdepääsetavate teaduslike edusammude jaoks. Kas kõrvaldades teadlaste vajaduse oma riistvara või andmetöötluse infrastruktuuri järele või avaldades katsete tulemusi plokiahela pearaamatus nii, et need oleksid jälgitavad ja reprodutseeritavad, on organisatsioon võtnud endale kohustuse teha koostöö kaudu võimalikuks rohkem innovatsiooni – rikkudes vaesusest tingitud tõkkeid. kasutatavus ja silotatud, nišiteadmised.

LabDAO jõupingutused selle DeSci tulevikumaailma ehitamiseks tänaseks said hiljuti tõuke 3.6 miljoni dollari suuruse rahastamisvooru näol erinevatelt teistelt DAO-delt, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan ja teised. See toetuse sissevool aitab kaasa jätkuvatele jõupingutustele avatud lähtekoodiga tarkvaratööriistade väljatöötamiseks ja LabDAO teadusuuringute ökosüsteemi tugevdamiseks.

Mis puutub PLEX-i endasse, siis järgmisteks sammudeks on silmapiiril platvormi testimine erinevates teaduskoostöös, erinevate tööriistade konteinerisse paigutamine ja vajaliku riistvara kogumine BioML-i võrgu edendamiseks.

Mis puutub pikas perspektiivis, siis võib-olla kavandatakse järgmine elupäästev ravim järgmise suurema nakkushaiguse puhangu ajal PLEX-i jõul, üks detsentraliseeritud samm korraga. Kuna ökosüsteem kasvab jätkuvalt, näitab ainult aeg.

Aitäh Aishani Aatresh selle artikli kohta täiendavate uuringute ja aruandluse jaoks. Olen SynBioBeta asutaja ja mõned ettevõtted, millest kirjutan, on selle sponsorid SynBioBeta konverents. Rohkema sisu saamiseks võite tellida minu nädala uudiskiri.